Gua Maria ini dibangun atas permintaan Romo Everardus Wiegers, SJ, untuk merayakan ulang tahun imamatnya yang ke-50 dan diresmikan pada 15 Agustus 1986. Renovasi dilakukan pada masa kepemimpinan Romo Ponco Sukamat, SJ, dan diberkati oleh Uskup Agung Jakarta, Julius Kardinal Darmaatmadja, SJ, pada 14 Juli 1998.